В игре Half-Life рассказывается история физика-ядерщика Гордона Фримена, очередной рабочий день которого закончился вовсе не как обычно. Прибыв на работу в Черную мезу, Гордон отправляется участвовать в научном эксперименте, который вышел из-под контроля и привел к катастрофе в виде портала, через который в комплекс нахлынули многочисленные агрессивно настроенные пришельцы из параллельного мира Зен.
Фримен через тот же портал отправился в обратном направлении, где добрался до лидера пришельцев и убил его, благодаря чему портал был закрыт. Однако было уже поздно: теперь уже вся планета приняла на себя вторжение пришельцев и дело стало совсем плохо. С критической ситуацией при поддержке повстанцев может прийти на выручку лишь один человек - это как раз Гордон Фримен, управляемый игроком.
