Мутации в Dead Cells представляют собой игровую механику, которая дает персонажу временные показатели, вроде урона, скорости, количества боеприпасов и так далее. По умолчанию подавляющее большинство всех мутаций закрыто, но может быть открыто впоследствии усилиями игрока при помощи чертежей у Коллекционера. При этом использовать одновременно можно лишь три мутации и не более.
Тем не менее, если вы по мере открытия новых мутаций решите, что старые вам особо не нужны и захотите их заменить на новые, то доступен сброс, правда, делается это только за золото. А еще мутации в Dead Cells поддаются усилению за счет Свитков усиления зеленого (выживаемость), красного (брутальность), фиолетового (тактика). Свитки белого цвета не улучшаются за исключением мутации Инстинкт оружейного мастера.